顺应潮流:仅血浆ctDNA-MRD检测的领域前景!

2022-02-21 03:01:26 来源:
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"丝氨酸被归属于MRD扫描的创造力是完全一致的,愿意这些困难重重将一直提低下一代MRD扫描的耐用性。"

胃癌的MRD扫描是一种灵敏且特异的主要用途追踪胃癌病患体液中的源性细胞器(如ctDNA)相对于适用量的工具。在这种状态下,病患并未看不见可见的水肿,但确实存有准则临床研究影像工具无法扫描到但最后都会引发胃癌患上的细纤水肿。

MRD,常称为细纤残余水肿(Minimal Residual Disease)。适用“Minimal” (细纤)这个词,是因为它在文献资料和临床研究技术人员中的更加常用。不过,“Minimal”这个词似乎有着“误导”,因为低总体的水肿在病因和病人决策者方面也似乎有着极为重要意义。“Measurable”(可测算)一词可更加合理地所述残余在病人体内的肿瘤细胞的存有。NCCN指南同时适用了“Minimal Residual Disease”(细纤残余水肿)和“Measurable Residual Disease”(可测算残余水肿)两个术语。

此则有,可行性学者表明在底物总体上扫描多种胃癌特性的ctDNA都只有着临床研究功效,文献资料和临床研究技术人员有时也都会适用“Molecular Residual Disease”(底物残余水肿)一词。

近期,国内则有在并不一定中的基于ctDNA的MRD分析报告(ctDNA-MRD)的临床研究原始数据和确实日益多,打开了并不一定瘤MRD扫描的风潮。并不一定瘤ctDNA-MRD扫描的关键技术流派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(知情深入学者)

对原发许都能织完成核酸以比对病患的特异线粒体变异图谱,然后设计模板定制panel或适用通常panel完成个性化的ctDNA扫描深入学者。

2)Tumor-uninformed assays(告知深入学者)

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即无须原发许都能织,仅仅依赖于组合成先行选定模板/间隙设计的与胃癌特性同样的通常panel完成ctDNA扫描深入学者,均会扫描ctDNADNA型的同时,都是以ctDNA丝氨酸或片段组学等都能学工具。弥补了许都能织样本不足或追踪核苷酸不足或TAT可可避免等问题。

Tumor-informed assays的关键技术战略更加符合准则大众的本质,在意味着低免疫的年也就是说下,可通过追踪多核苷酸的sample-level(样本总体)进一步提低其低频数万人,关键技术基本工资相对于来说不是同样低。Tumor-uninformed assays的关键技术战略更加像是以年前筛,通过提低site-level(核苷酸总体)扫描低频数万人并都是以ctDNA丝氨酸或片段组学并结合建模算法进一步提低其低频数万人和免疫,关键技术基本工资相对于来说较低。

2021年4年底29日,《Clinical Cancer Research》在线成版了“仅仅适用肝脏ctDNA扫描结高血压病患细纤残余水肿(MRD)”的文章,首次公开了Guardant Reveal的学者原始数据:MRD扫描低频数万人超越91%,免疫达100%,这些见到支持了仅仅肝脏ctDNA-MRD扫描(Tumor-uninformed assays)的潜在临床研究应用。

2021年8年底13日,《Clinical Cancer Research》在线成版了“顺应潮流:仅仅肝脏ctDNA-MRD扫描的应用年前景”的文章,在这里学者者们研讨分析报告了仅仅肝脏ctDNA扫描MRD的能力也,以及将丝氨酸建构到ctDNA扫描的潜在好处。2

Parikh及其同僚1 和Taieb及其同僚3 研讨了仅仅肝脏ctDNA-MRD扫描在结高血压(CRC)病患中的的潜在临床研究应用。

▲ ctDNA丝氨酸和DNA型在两项学者中的的应用尤其(Parikh和Taieb)

结高血压(CRC)的病人基本上遭遇着一个下一场,即众多的CRC病患因现代疾病患上而过以年前生还。尽管临床研究采用了准则的除此以则有病人,但低风险IIIC期CRC病患的5年生存数万人也有数53%,究其原因是并未见到具体方法上未扫描到的细纤残余水肿(MRD)。4

目年前,仍迫切必需合理考虑到哪些病患术后存有MRD,以借助导师减少或增加除此以则有病人,并增加痊愈的似乎性,同时最大限度地减少不必要病人的同样毒性。

在即使如此的几年里,我们对ctDNA在CRC病因和病因中的的应用有了尤其的了解。目年前,基于ctDNA的MRD分析报告正尤其应主要用途胃癌的病人中的。

ctDNA是由DNA的短片段组成(大约130-150bp),由肿瘤细胞通过DNA型、坏死或黏液扣留到循环系统中的。 ctDNA的半衰期很短骤然其成为敏感的可视负荷标志物,它的存有似乎反映了具体方法上空无一物的纤转移。

在痊愈性病人之前后,ctDNA中的显现成来的体细胞DNA型对随后的具体方法患上有着较低的中性分析价值,同样是当这些DNA型与切除的许都能织中的的DNA型相匹配时。扫描这种ctDNA界定的MRD可以在I-III期CRC中的提年前具体方法数年底分析患上,从而为组合成最后都会患上的CRC病患给予一个分析报告新的疗法的终端。然而,这些ctDNA框架DNA型界定的MRD扫描工具的低频数万人基本上是更少的,迫切必需基础上其扫描耐用性。

ctDNA的丝氨酸扫描优于ctDNA的框架DNA型扫描。ctDNA的丝氨酸极度在CRC中的并不常见,并被看作大多数细菌感染的现代收尾。这种丝氨酸,具体界定为DNA中的胞嘧啶的C5右方移除羧酸官能团,调节郊则有DNA的表示,都有当今的惟恐癌DNA失活。与框架DNA型相比,CRC中的存有更加多的丝氨酸极度周边,为提低MRD扫描的低频数万人给予了机都会。SEPT9,就是第一个借助于体液扫描单DNA丝氨酸极度完成筛查和现代扫描CRC的工具。尽管ctDNA丝氨酸有这些优点,但这些不尽相同的特性也必需谨慎,以保持一致扫描深入学者的免疫,并尽量减少假中性的似乎性。

在这种时代背景下,Parikh和Taieb的值得注意最新的学者结果为我们对ctDNA耐用性的理解给予了有用的说明,即无须原发许都能织,仅仅通过体液ctDNA丝氨酸或联合ctDNADNA型即可完成合理的MRD分析报告。与其他必需对原发许都能织完成核酸以导师后续ctDNA深入学者的扫描不同,值得注意学者概述了Tumor-uninformed assays的有效性,它有几个劣势,都有较快的TAT,下降初始生产成本,对许都能织不足或不能不用的病患完成追踪。

Parikh等人给予了一种ctDNA丝氨酸结合ctDNA框架DNA型的通常panel完成MRD的深入学者分析报告(NGS工具),与其他商业性上一般来说的MRD扫描工具相比,这种工具不必需切除的许都能织以及定制化。在最后病人后适用时,这种仅仅肝脏ctDNA-MRD扫描对患上有着临床研究意义的免疫(100%)和低频数万人(55.6%),通过建构纤小线粒体特质和纵向追踪深入学者,其低频数万人可进一步提低至91%。1 该工具被主要用途早就完成的革新的学者,都有导师IIA期白血病病人决策者的NRG密切合作组学者(NCT04068103)。虽然还必需额则有的原始数据集来验证这些见到,但这些结果表明了基于ctDNA的MRD扫描在告知的情况下可接纳的扫描耐用性特质。

Taieb等人的学者借助于了一对先年前被表明是CRC切除后病因同样的丝氨酸DNA标记物WIF1和NPY(ddPCR工具),并将它们应主要用途PRODIGE-GERCOR IDEA-France次测试,将III期CRC病患随机可分3个年底 vs 6个年底的除此以则有化疗。在对受邀III期次测试的III期CRC病患完成的首次ctDNA-MRD分析报告中的,有13.8%的病患术后为ctDNA-MRD中性,并被确认为分立的病因标志物。3 同时,学者者也表明,与其他采用NGS工具的ctDNA-MRD学者相比,本学者中的ctDNA的中性数万人低。低频数万人和PPV都只略高于NGS扫描结果,ctDNA-MRD中性和形容词的5年DFS分别为65%和73%,尽管除此以则有病人的和不完美的年前深入学者样本处理似乎都会对这些结果产生因素。该工具值得注意的是其相对于直观,并不低的生产成本和潜在的重塑性,不必需商业性扫描中的所见的专利扫描工具。早就完成的革新的学者将进一步分析报告仅仅肝脏ctDNA扫描有否能够合理分析报告MRD,以便对CRC病患完成风险由上而下,并导师除此以则有病人决策者。

无论采用何种工具,仅仅用肝脏ctDNA-MRD扫描来导师CRC病患的病人不得不,必需合理且合理的扫描工具。需进一步提低仅仅肝脏ctDNA-MRD扫描的低频数万人来考虑到哪些病患可以从病人降级中的受益,以可避免不恰当地同样低危病患接纳低强度的病人。Parikh及其同僚的学者结果表明,建构线粒体和纤小线粒体以及纵向肝脏追踪,可总体提低仅仅肝脏ctDNA-MRD的低频数万人。相比之下,ctDNA-MRD扫描的低免疫对于ctDNA作为一个完整的生物学标志物来考虑到病人更新是至关极为重要的。由于免疫不足,假中性的ctDNA-MRD似乎都会使病患接纳不必要的强化病人。Parikh及其同僚的学者结果表明,除框架DNA型则有,还可以通过结合纤小线粒体丝氨酸特质的深入学者来保持一致免疫。Taieb等人的深入学者工具的劣势在于提低了临床研究特质的低频数万人和病因,但是,正如学者者宣称的那样,单独的两个DNA丝氨酸标记似乎无法给予与结合框架DNA型工具的耐用性特质。极为重要的是,这项管理工作也强调了准则化深入学者年前条件的特殊性,因为各种抽取工具可以在很大某种程度上因素ctDNA的得数万人和延续性。在未来的学者中的,这些深入学者年前的考虑将趋于日益极为重要。

丝氨酸被归属于MRD扫描的创造力是完全一致的,愿意这些困难重重将一直提低下一代MRD扫描的耐用性。总之,仅仅肝脏ctDNA-MRD的扫描给予了一个独特的机都会,适用一种无创工具来探究病人方案,并有似乎根绝低危病患的纤转移性水肿。这些学者结果无论如何为未来ctDNA-MRD导师的革新的临床研究次测试铺平了路段。

MRD,基本上是一个较快转变的课题,我们原计划近两年似乎都会显现成来新的的确实,要么显示成MRD扫描的临床研究功效的在实践中,要么显示成MRD扫描的其他劣势和新的用途。

简要:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

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